Pendidikan imam berkurikulum Jerman sejak lama menjadi kerikil dalam hubungan antara pemerintah dan organisasi Islam. Kini, konflik tersebut mulai mencair.
Kekaisaran Jerman pernah menggunakan masjid sebagai tempat untuk bangkitkan sentimen negatif tawanan perang muslim untuk berperang lawan Prancis dan Inggris.