Banyaknya kasus keracunan yang terjadi pada program MBG membuat para dapur Satuan Pelayanan Pemenuhan Gizi memperketat keamanan makanan sebelum distribusi.
Ahli gizi Tan Shot Yen melontarkan kritikan pedas terkait program MBG. Tan menyoroti menu MBG di beberapa daerah yang menyajikan burger hingga spageti.