Sebelumnya, Kemenag berkomitmen untuk segera membentuk Direktorat Jenderal Pondok Pesantren sebagai bentuk dukungan terhadap eksistensi dan kemajuan pesantren.
Dalam upaya meningkatkan mutu pendidikan pesantren, Menag Nasaruddin Umar mendukung program Majelis Masyayikh. Salah satunya dalam meluncurkan aplikasi SYAMIL.