Pupuk ZA atau urea dalam pembuatan nata de coco bisa menimbulkan cemaran berbahaya. Untuk menghindarinya, maka harus melalui proses pembuatan yang tepat.
Pupuk ZA dan urea yang digunakan dalam pembuatan nata de coco harus dalam kategori food grade yang khusus untuk bahan pangan agar tidak mengandung pencemaran.
Sebuah pabrik nata de coco di Majalengka digerebek polisi karena diduga mencampurkan pupuk ZA. Menurut pakar, ZA memang dipakai dalam pembuatan nata de coco.
Nata de coco yang diproduksi UKM di Kabupaten Majalengka ternyata diedarkan di wilayah Cirebon. Produsen tidak melabeli merk, pembeli yang memberikan merknya.