Anak almarhum Ki Joko Bodo, Refo, menceritakan kronologi ayahnya berpulang. Disebut juga Ki Joko memiliki riwayat penyakit komplikasi seperti darah tinggi.
Ki Joko Bodo meninggal di usia 57 tahun. Sebelum meninggal, ia disebut memiliki riwayat penyakit hipertensi. Ini penyebab hingga komplikasi hipertensi.