Sejumlah pemantau Pemilu menemukan sejumlah masalah pada hari H Pemilu 2004. Sebagian besar disebabkan ketidakprofesionalan KPU.

Aliansi sejumlah elit parpol yang menolak pemilu diragukan berdiri sendiri. Diduga kuat, ada kekuatan lain yang memiliki tujuan tertentu di belakang aliansi tersebut.

PT Asgarindo membantah kalau tinta lokal yang diproduksi untuk Pemilu 2004, kualitasnya rendah.