Insiden Cebongan juga membuat pemerintah Timor Leste was-was. Mereka khawatir warga negaranya jadi korban salah sasaran, karena memiliki kemiripan dengan warga NTT.

Keluarga empat tahanan yang dibunuh di Lembaga Pemasyarakatan Cebongan, Sleman, menuntut keadilan. Di Sekretariat Dewan Pertimbangan Presiden, mereka menyampaikan uneg-unegnya seraya menolak keempat korban disebut sebagai preman.

Tim Pengacara Muslim (TPM) mengaku telah diminta untuk mendampingi proses hukum para tersangka penyerangan LP Cebongan. Mereka berharap Panglima TNI memberikan rekomendasi agar tersangka mendapat pendampingan dari pengacara independen.

Masyarakat terpecah belah menyikapi penyerangan Lapas Cebongan, Sleman oleh 11 anggota Kopassus Grup 2 Kandang Menjangan. Khusus di Yogyakarta, beredar kampanye pembersihan premanisme.

Massa 'Anak Kolong Bergerak' cs mendemo Komnas HAM, mendesak lembaga bentukan pemerintah itu tidak mendukung preman yang dibunuh anggota Kopassus. Menanggapi ini, Komnas HAM menegaskan pihaknya tidak mendukung preman.

Kasus penyerangan Lapas Cebongan, Sleman yang dilakukan 11 anggota grup 2 Kopassus menjadi pembicaraan masyarakat. Tapi perkembangan kasus kemudian bergeser ke arah pemberantasan premanisme.

Soal kasus LP Cebongan, eks Pangdam IV Diponegoro Mayjen Hardiono Saroso kini lebih suka bicara ke depan. Jenderal yang kini menjadi staf KSAD itu mengaku bangga terhadap 11 anggota Kopassus yang saat ini diperiksa Pomdam terkait kasus LP Cebongan.

Menteri Pertahanan, Purnomo Yusgiantoro menegaskan hukuman bagi prajurit Kopassus yang melakukan penyerangan di Lapas Cebongan, Sleman lebih berat dibandingan dengan kasus pidana biasa.  

Beberapa jam setelah penyerangan LP Cebongan Sleman, Mayjen Hardiono Saroso yang kala itu menjabat Pangdam Diponegoro ngotot TNI tak terlibat. Namun akhirnya berdasarkan hasil tim investigasi TNI AD terkuak bahwa pelaku adalah 11 oknum anggota Kopassus. Apa alasan Hardiono ngotot saat itu?

Selain menggalang tanda tangan untuk 11 oknum Kopassus penyerang LP Cebongan, seratusan orang dari 'Anak Kolong Bergerak' demo di Komnas HAM. Pendemo meminta Komnas HAM tidak diskriminatif terhadap TNI dan Kopassus.