Selain untuk irigasi pertanian, manfaat sumber air dari waduk Bajulmati juga dirancang untuk penyedia air baku, penahan banjir, pembangkit listrik dan wisata.
Saking parahnya banjir di Pondok Labu, mengakibatkan 3 tembok rumah warga jebol. Ketiga rumah tersebut posisinya berada di sekitar aliran Sungai Krukut