Pemilu menyisakan kepiluan di Sidoarjo, Jatim. Empat orang petugas pemilu meninggal dunia saat menjalankan tugas. Dua di antaranya tewas tertabrak bus.
Meski secara umum Pemilu 2004 di Sulteng berjalan lancar, namun di beberapa TPS timbul masalah. Misalnya, 8 TPS di Tolitoli memutuskan untuk menunda pemungutan suara.