Anies menyinggung pembangunan jalur Transjakarta layang yang tak terintegrasi dengan jalur MRT Lebak Bulus-Bundaran HI. Proyek itu dibangun di era Ahok.
Anies Baswedan memutuskan mempersingkat jadwal layanan operasional bus guna mencegah penyebaran Corona. Keputusan itu menimbulkan permasalahan di lapangan.
Dishub DKI Jakarta menerbitkan SK soal Transportasi untuk Pencegahan COVID-19 di Masa Transisi. SK itu mengatur soal jam operasional TransJ hingga MRT.