Kemenag mempersilakan para pihak yang diberhentikan dari jabatannya, seperti Dirjen Bimas Kristen, Katolik, Hindu, dan Buddha, melayangkan gugatan ke PTUN.
Dirjen Bimas Kristen Kemenag Thomas Pentury buka suara usai diberhentikan oleh Menag Yaqut Cholil Qoumas. Dia kaget karena dicopot dari jabatannya tanpa alasan.
Yohanes Bayu Samodro tidak mempermasalahkan pencopotannya dari jabatan Dirjen Bimas Katolik Kemenag. Yohanes menerima keputusan tersebut dengan ikhlas.