Selain Gubernur dan Wagub Papua, Prabowo juga melantik sejumlah sejumlah pejabat. Di antaranya, Wamendagri Akhmad Wiyagus dan Bos LPS Anggito Abimanyu.
Gregory Hendra Lembong yang sebelumnya menjabat sebagai Wakil Presiden Direktur kini menjabat sebagai Presiden Direktur menggantikan Tjahja Setiaatmaja.