Ada sejumlah kasus yang mewarnai maraknya gelaran Pilkada Jatim 2018. Mulai dari penangkapan sejumlah kepala daerah petahanan oleh KPK hingga coblosan ulang.
Bupati Kabupaten Ngada, Marianus Sae, ditangkap KPK dalam sebuah operasi tangkap tangan (OTT). Marianus menjadi calon kepala daerah kedua yang terkena OTT.