Perjalanan KRL dari arah Bekasi juga mengalami rekayasa. Sebagian kereta hanya bisa melintas hingga Manggarai akibat banjir di jalu Stasiun Jakarta Kota.
PT Kereta Commuter Indonesia mengganti wesel di Stasiun Jakarta Kota. Perjalanan KRL dari Bekasi dan Bogor yang menuju Jakarta hanya sampai Stasiun Manggarai.
"Proses penggantian wesel Gambir telah mencapai tahap akhir, namun rekayasa pola operasi KRL lintas Stasiun Manggarai-Jakarta Kota sudah tidak diberlakukan."