Salah satu fatwa Buya Hamka saat menjabat Ketua MUI yang terkenal adalah soal natal. Ia mengharamkan muslim mengucapkan atau merayakan natal bersama umat Nasrani.
Kasus pelanggaran HAM yang dilakukan oleh PKI tahun 1960-an terbengkalai. Ratusan ormas anti komunis mendatangi kantor KomnasHAM, menuntut Komnas HAM dibubarkan.
Draf RUU Jaminan Produk Halal mencantumkan proses sertifikasi halal akan dilakukan Departemen Agama. Sedangkan MUI hanya akan dimintai fatwa tentang halal saja.
Aliran Al Qiyadah Al Islamiyah telah dinyatakan sesat dan dilarang di Indonesia. Namun penganut aliran pimpinan Ahmad Musaddeq itu ditengarai masih beraktivitas.
Dengan jumlah penduduk dengan mayoritas muslim, gerakan ekonomi syariah perlu dikembangkan di Indonesia. MUI pun tak segan-segan cerewet ke pemerintah.