Yahya pernah jadi Jubir Presiden Gus Dur dan Wantimpres Jokowi-Kalla. Dia juga pernah bertemu Paus Fransiskus. Sempat dihujani kritik saat berkunjung ke Israel.
Menag Yaqut Cholil meresmikan desa sadar kerukunan di Kalurahan Pendowoharjo, Sewon, Bantul, DIY. Penamaan tersebut diklaim sebagai yang pertama di Indonesia.
Menag Yaqut Cholil Qoumas mengapresiasi langkah Polri menangkap dua pelaku penistaan agama dalam waktu berdekatan yakni Muhammad Kece dan Yahya Waloni.