LP3ES menyadari mendapatkan kritik lantaran adanya ketimpangan terhadap keterwakilan perempuan. Oleh sebab itu, LP3ES mendirikan pusat gender dan demokrasi.
Kiwil sering dikabarkan menikah lagi dan melakukan poligami. Kini, sang istri, Rohimah, justru menggugat cerai Kiwil ke Pengadilan Agama Jakarta Selatan.