Mekanisme penggunaan tol fungsional dari Brebes ke Weleri sepanjang 110 kilometer akan bergantung pada kepadatan volume kendaraan yang melintas di Tol Cipali.
13 tempat beristirahat pengendara terbagi menjadi dua jenis, yaitu rest area dan parking bay. Parking bay merupakan tempat istirahat namun lebih mini bentuknya.