Jalur kereta api (KA) di Jakut beberapa kali terendam banjir rob hingga perjalanan KA terganggu. KAI meninggikan rel jalur KA hingga memperlancar drainase.
Perjalanan KRL rute Stasiun Jakarta Kota-Tanjung Priok kembali dioperasikan usai rob surut. Sebanyak 14 perjalanan KRL sempat dibatalkan saat banjir rob.
Jalur kereta antara Tanjung Priok ke Jakarta Kota dan sebaliknya saat ini sudah bisa dilalui KRL. KRL dapat melintas dengan kecepatan maksimum 5 kilometer/jam.
Tiang LAA yang miring di antara Stasiun Cakung dan Stasiun Bekasi telah diperbaiki. Kereta api jarak jauh (KAJJ) maupun KRL sudah dapat melintas di lokasi.