Kisruh sepakbola nasional yang kemudian merambat ke kepengurusan daerah berefek pada penyelenggaraan PON XVIII. Provinsi Riau dan Jawa Barat mengirim dua tim sepakbola, dari dua kepengurusan yang berbeda.

Sejak desentralisasi daerah 1999 hingga 2009, terbentuk 205 daerah otonomi baru. Penambahan daerah otonomi baru itu membuat Indonesia memegang rekor dunia sebagai negara pemekaran daerah terbanyak.